Abstrakt

Charakterisierung des vollständigen Chloroplastengenoms von Rhus Chinensis (Anacardiaceae), einer wichtigen Heil- und Nutzpflanze aus China

Zhumei Ren, Ting Lv, Xu Su und Jun Wen

Rhus chinensis ist ein in der warmgemäßigten Zone Ostasiens verbreiteter Laubbaum, auf dem die Chinesische Sumachblattlaus lebt, die tanninreiche Gallnüsse bildet. Hier haben wir das komplette Chloroplastengenom von R. chinensis mit der Shot-Gun-Genomskimming-Methode auf einer Illumina HiSeq4000-Plattform zusammengesetzt. Das komplette Chloroplastengenom von R. chinensis war 149.083 bp lang und hatte eine standardmäßige vierteilige Struktur mit den großen (LSC, 97.271 bp) und kleinen (SSC, 18.524 bp) Einzelkopieregionen, die durch ein Paar invertierter Wiederholungen (IRs, jeweils 16.644 bp) getrennt waren. Wir haben erfolgreich 126 Gene annotiert, darunter 82 proteinkodierende Gene, 36 tRNA-Gene und acht rRNA-Gene. Unter diesen Genen befanden sich 29 in IR-Regionen. Der gesamte GC-Gehalt des kompletten Chloroplastengenoms erreicht bis zu 45,5 %.