Abstrakt

Dynamische DNA-Methylierung von Retrotransposonen in Raute unter Trockenstress

Bruna De Felice, Olga De Castro und Francesco Manfellotto

Ruta graveolens (Weinraute) ist eine im Mittelmeerraum beheimatete Pflanze, die seit der Antike in der traditionellen Medizin dieser Region vorkommt. Über das Genom der Weinraute gibt es nur wenige Informationen, und repetitive Sequenzen und aktive mobile genetische Elemente wurden bisher nicht identifiziert. Da das Genom der Weinraute noch weitgehend unerforscht ist und Transposonen aufgrund ihrer proliferativen Fähigkeit und Größe wichtige Beiträge zur Genomgröße und -entwicklung leisten, wollten wir Transposonsequenzen isolieren und charakterisieren, um das Genom der Weinraute besser zu verstehen. Wir haben neuartige Ty1-Copia-Typen wie die LTR-Reverse-Transkriptase aus Ruta graveolens isoliert, was zur Untersuchung der genomischen Organisation und der phylogenetischen Beziehungen führte. Da die Aktivierung transponierbarer Elemente als Reaktion auf Umweltveränderungen eine Form der adaptiven Reaktion auf biotischen Stress darstellt, untersuchten wir, ob Trockenstress die Transposonmethylierung beeinflussen kann und ob das Ausmaß der Methylierung mit dem Expressionsniveau zusammenhängt. Die Ergebnisse können Auswirkungen auf das Verständnis des Genoms der Weinraute und ihre möglichen Auswirkungen auf die Evolution der Weinraute haben.