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Mikrowellen sind eine Form elektromagnetischer Strahlung mit Wellenlängen von 1 m bis 1 mm und Frequenzen zwischen 290 MHz und 290 GHz. Mikrowellen werden in zahlreichen organischen und biologischen chemischen Synthesen eingesetzt; praktisch seit man ihre Fähigkeit als Wärmequelle entdeckt hat. Bestehende Mikrowellenanwendungen im Labormaßstab bei der Biodieselherstellung haben gezeigt, dass die Technologie bessere Ergebnisse als konservative Ansätze erzielen kann. Der Energieverbrauch und die spezifischen Energieanforderungen für die mikrowellenbasierte Biodieselmischung sind angeblich besser als bei herkömmlichen Techniken. Mikrowellen können auch in den Phasen der Rohstoffzubereitung, -gewinnung und -veresterung des Biodieselherstellungsprozesses eingesetzt werden. Während Mikrowellentechnik in anderen Bereichen der Lebensmittel-, Pharma- und Polymerchemieforschung und -industrie weit verbreitet ist, muss sie ihre Zukunft in der Biodieselindustrie bei groß angelegten Anwendungen erst jetzt unter Beweis stellen.