Abstrakt

Computergestützte Biomodellierung und Analyse der 3D-Struktur des menschlichen Proto-Onkogens c-Rel: Ein Tumorigenese-Aktivatorprotein

Atala Bihari Jena und Shasank Sekhar Swain

Mit dem Aufkommen der biomedizinischen Forschung im Bereich der Humanwissenschaften wurden mehrere Proteine ??im menschlichen Körper gefunden, die eine Gefahr für die Gesundheit darstellen. Das Proto-Onkogen-c-Rel-Protein kommt hauptsächlich beim Menschen vor, wird durch das REL-Gen kodiert und gehört zur Rel/NF-kB-Transkriptionsfaktorfamilie, die eine Vielzahl von Zellfunktionen reguliert. Proto-Onkogene sind beteiligt und spielen eine große Rolle bei der Differenzierung und Lymphopoese. Proto-Onkogene können schädlich sein und Krebs verursachen, wenn sie mutiert sind. Um den Wirkungsmechanismus des MENSCHLICHEN Proto-Onkogen-c-Rel-Proteins zu verstehen, ist es zwingend erforderlich, das Strukturmodell dieses bestimmten Proteins zu verstehen, aber die dreidimensionale (3D) Struktur wurde bisher nicht in der Protein Data Bank (PDB) gemeldet. In der vorliegenden Studie wurde eine vollständige Strukturanalyse und 3D-Modellierung des menschlichen Proto-Onkogens c-Rel von Homosapiens durchgeführt. Basierend auf dem PDB Blast-Bericht wurde die dreidimensionale Struktur des Proto-Onkogen-c-Rel-Proteins mithilfe des SWISS MODEL vorhergesagt. Das vorhergesagte Modell wurde weiter von SAVES (PROCHEK, VERIFY 3D, ERRAT) und Ramachandran Server bewertet, die akzeptable Bewertungen und die Zuverlässigkeit des endgültigen, verfeinerten Modells zeigten. Das Gesamtergebnis liefert den Beweis für die gute Qualität des Modells und liefert eine angemessene Grundlage für die Funktionsanalyse experimentell abgeleiteter Kristallstrukturen und hilft auch in der Krebsforschung, indem es einen neuen Ausgangspunkt für die strukturbasierte Arzneimittelentwicklung des Proto-Onkogen-c-Rel-Proteins liefert.