Abstrakt

Genomische Diversität von Arcobacter spp. aus Oberflächengewässern isoliert

Rodrigo Alonso, Irati Martínez-Malaxetxebarria, Cecilia Girbau, Sandra Carmona, Héctor Velasco, Aurora Fernández-Astorga

Insgesamt wurden 45 nicht-klonale Arcobacter- Isolate untersucht, die aus Abwasser- und Flusswasserproben rund um Vitoria-Gasteiz im Norden Spaniens gewonnen wurden. Unsere Ergebnisse bestätigten A. butzleri als vorherrschende Art, obwohl auch A. cryaerophilus und A. lanthieri identifiziert wurden. Acht Isolate zeigten widersprüchliche Ergebnisse bei den identifizierenden m-PCRs. Basierend auf der rpoB-Gensequenz erwiesen sich zwei dieser acht Isolate als A. lanthieri . Bei den sechs verbleibenden schienen es sich jedoch um mögliche neue Arten zu handeln, die weiterer Analyse bedürfen. Das Vorkommen virulenzassoziierter Gene war bei A. butzleri signifikant (P < 0,05) höher . Sieben der zehn untersuchten virulenzassoziierten Gene ( ciaB, mviN, tlyA, cadF, pldA, cj1349 und hecA ) waren in einer großen Anzahl von Isolaten vorhanden. Unter ihnen war das hecA -Gen signifikant (P<0,05) mit Isolaten aus Abwasser verwandt. MLST zeigte eine hohe genetische Diversität für A. butzleri -Isolate. Es gab jedoch keine Anzeichen für einen Zusammenhang zwischen STs und dem Vorhandensein von virulenzbezogenen Genen. Abschließend lässt sich sagen, dass die Arcobacter- Population in Oberflächengewässern möglicherweise vielfältiger ist als festgestellt, da die meisten Anreicherungsmedien und molekularen Techniken auf der Grundlage von A. butzleri entwickelt wurden und dies die Informationen zugunsten dieser Art verzerren könnte. Darüber hinaus fanden wir einen möglichen Zusammenhang zwischen dem Gehalt an virulenzassoziierten Genen und dem Ursprung der Isolate.