Abstrakt

In-silico-Screening des Proteins Rv3228, um einen Einblick in das Überleben und die Pathogenese von Mycobacterium tuberculosis H37Rv zu erhalten

Hanisha Sharma, Swati Meena, Laxman S Meena

Tuberkulose hat sich zu einem der größten weltweiten Gesundheitsprobleme entwickelt; fast ein Drittel der Weltbevölkerung ist heute mit dem Erreger Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis) infiziert. M. tuberculosis ist ein grampositives Bakterium, dessen vollständige Ausrottung große Schwierigkeiten bereitet. Rv3228 ist ein konserviertes hypothetisches Gen von M. tuberculosis. Rv3228 ist ein erwartetes GTP/ATP-bindendes Protein. Es zeigt auch Metallionenbindung oder GTPase-Aktivität. GTP/ATPs sind energiereiche Moleküle, die die Bindung des jeweiligen Proteinfaktors entweder an Ribosomen oder an die tRNA erleichtern. In dieser Abhandlung werden einige der wertvollen Aspekte des Rv3228-Proteins betrachtet, dessen Funktion unbekannt ist. Die wichtigsten Ziele dieser Studie umfassen den Abruf einer Protein-Sequenzdatenbank, die Ausrichtung mehrerer Sequenzen, String-Interaktionsstudien, subzelluläre Lokalisierung, Vorhersage der Ligandenbindung, Vorhersage von B-Zell- und T-Zell-Epitopen sowie strukturbasierte Funktionsvorhersage durch COFACTOR und VICMpred. VICMpred sagt voraus, dass dieses Gen ein Virulenzfaktor ist. Ab-Inito-Modellierung durch RAPTOR X und Validierung durch RAMPAGE, ERRAT und VERIFY3D, Mutationsanalyse durch MAESTRO WEB SERVER. Diese Studie wird bei der Entwicklung neuer Medikamente und der Behandlung von Tuberkulose hilfreich sein.