Abstrakt

Molekulare Dockinganalysen von Phytochemikalien aus afrikanischen Kräuterpflanzen zeigen hemmende Wirkung gegen therapeutische Ziele von SARS-Cov-2

Goni AbrahamDogo, Uchechukwu Ohaeri, Uzal Umar, Aboi J. Madaki, John C. Aguiyi

Viruserkrankungen sind nach wie vor die weltweit häufigste durch Infektionserreger verursachte Todesursache. Eine internationale Bedrohung für die öffentliche Gesundheit stellt derzeit das Schwere Akute Atemwegssyndrom Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) dar, der Erreger der weltweit verbreiteten Coronavirus-Krankheit 2019 (COVID-19). Pflanzen weltweit, darunter auch Pflanzen mit ethnopharmakologischer Relevanz in Afrika, sind eine natürliche Quelle reichhaltiger und vielfältiger sekundärer Pflanzenstoffe mit biologischer Aktivität gegen Mikroorganismen, darunter auch Viren. Wir haben 13 Pflanzen ausgewählt, die in der traditionellen afrikanischen Medizin zur Behandlung von Viruserkrankungen verwendet werden, um mithilfe des In-silico- Ansatzes Auto Docking Vina nach sekundären Pflanzenstoffen zu suchen, die die therapeutischen Zielmoleküle des Schweren Akuten Atemwegssyndroms Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) stören können. 25 sekundäre Pflanzenstoffe aus diesen Pflanzen, die die Lipinski-Regel der Arzneimittelähnlichkeit bestanden, wurden auf ihre antivirale Aktivität gegen drei therapeutische Zielmoleküle von SARS-CoV-2 untersucht, nämlich Spike-Glykoprotein, Papain-ähnliche Protease und 3C-ähnliche Proteinase. Die Kristallstruktur der viralen Proteinziele wurde von der Proteindatenbank-Website (https://www.rcsb.org/) bezogen. Die aktiven Stellen der Zielproteine ??wurden mithilfe des SCFBio-Servers (http://www.scfbio-iitd.res.in/dock/ActiveSite.jsp) aus der pdb-Datei als Eingabe vorhergesagt. Die antiviralen pflanzlichen Phytochemikalienverbindungen wurden dann mit Papain-ähnlicher Protease, 3C-ähnlicher Proteinase und Spike-Glykoprotein angedockt. Die Auto-Docking-Trefferergebnisse generierten sechs führende Phytochemikalien aus den fünfundzwanzig (25) Phytochemikalien, die aus den traditionellen afrikanischen Kräutern mit potenzieller Anti-SARS-CoV-2-Aktivität gewonnen wurden. Die Leitmoleküle mit ihren Bindungsaffinitäten gegen Papain-ähnliche Protease und 3C-ähnliche Proteinase sind wie folgt: Ginsenoside (-9,9), Ursolsäure (-9,4), Oleanolsäure (-9,4), Cynarin (-8,9), Glabridin (-8,5) und Cinnamoylechinadiol (-8,2). Wir plädieren für weitere In-vitro- und In-vivo -Studien, um die Aktivität dieser Leitverbindungen im Hinblick auf eine optimierte Arzneimittelintervention gegen die COVID-19-Pandemie zu bewerten.